南投縣政府環保局為徹底解決埔里鎮鯉魚潭優養狀態，於97年爭取到行政院環境保護署補助經費，辦理「南投縣鯉魚潭水質改善暨細部設計計畫」期以暸解該潭水質現況、污染源分布及其污染量，環保局自97年12月起持續辦理相關調查作業，藉以研擬最佳之改善措施，以期提升觀光品質，改善當地生活環境，使鯉魚潭成為民眾遊憩的好所在。(黃資茗報導)

環保局表示，鯉魚潭近年因遊客人數增加、水源水量降低、潭畔住家及民宿等將污水直接排放到潭內，且該潭無出流及入流口，使水質逐漸惡化，依據95、96年縣府環保局委託調查結果顯示，卡爾森指數為83(湖泊水庫優養程度分級標準，CTSI)已達到了超優養程度。該局於97年12月至98年3月期間，已完成2次非點污染源逕流之調查採樣，針對北潭及南潭各採集2點上、中、底層混合水樣與底泥進行分析；另執行潭周邊6處點污染源之調查採樣，後續持續辦理相關調查作業，調查結果將藉由水質模式得知該潭水質狀況並加以研擬最佳之改善措施，期使鯉魚潭恢復往日山明水秀、風光明媚的景象。

環保局並表示，該計畫執行目標為(1) 調查及評估集水區內點污染源產生之COD、BOD、氨氮、總磷污染量與流達污染量對鯉魚潭水質之影響。 (2) 調查及評估集水區內非點污染源對鯉魚潭水質之影響。(3) 調查及評估觀光開發區污水產生地點、產生之COD、BOD、氨氮、總磷污染量與流達污染量，以及觀光遊憩人潮所產生之污水對湖庫水質之影響。(4) 建立鯉魚潭水質模式，並應用模式計算鯉魚潭水庫涵容能力，評估鯉魚潭最大承載營養鹽的容量。(5) 依據各項污染源調查及分析評估結果，訂定確實可行之各項水質保護及改善方法與策略。